已多次听到苟或称赞钟繇，又听到他劝说李催、郭汜，对钟繇更加仰慕。后来李催胁迫天子，钟繇和尚书郎韩斌一起谋划对策。天子得以离开长安，钟繇对此是有功劳的。钟繇被授任为御史中丞，又升任侍中尚书仆射，一并记录以前的功劳封为束武亭侯。
曹操任命钟繇以侍中的身份领司隶校尉，持符节督察关中各路人马，将后方事务委托给他，特别授予他不受等级制度拘束的权力。钟繇到达长安后，送信给马腾、韩遂等人，为他们陈述利弊祸福，马腾、韩遂各送一个儿子入宫侍奉天子。太祖在官渡与袁绍相持，钟繇送去两千匹马供给军用。太祖给钟繇写信说：“得到送来的马匹，很是应部队的急需。关右地区平定，朝廷没有西顾之忧，都是足下的功勋。当年萧何镇守关中，粮供充足，以至大军获胜，也不过与你功劳相当。”此后匈奴单于在平阳郡作乱，钟繇率领各路人马包围他们，未能攻下；而袁尚所安置的河东太守郭援到了河东，人数很多。众将领议论想要放弃离去，钟繇说：“袁氏正在强盛的时候，郭援现在到来，关中众将暗中与他勾结，所以还没有全部反叛的原因，不过是顾忌我的威势名声罢了。假如放弃离去向他们示弱，这里所有的居民，谁不是我们的仇敌？即使我想回去，难道能够做到吗？这是尚未开战先自行败退啊！并且郭援刚愎自用，争强好胜，必定轻视我军，如果他们渡汾河扎营，我们趁他们没到对岸时打击他们，可以大获全胜。”张既劝说马腾来会合攻击郭援，马腾派他的儿子马超率领精锐部队迎面攻来。郭援到了以后，果然轻易地下渡汾河，众人劝止，不听。还未渡到河中央，钟繇发兵攻击，打得对方大败，斩杀了郭援，降服了单于。详见《张既传》。
此后河东卫固叛乱，与张晟、张琰及高干等人一同作乱，钟繇又率领众将领打败了他们。自从天子向西迁徙，洛阳百姓人口减少将尽，钟繇将关中民众迁徙过来，又招纳逃亡叛离的人口来充实，几年之内百姓户口逐渐充实。太祖征讨关中时，得以用来保障供给，因此上表任钟繇为前军师。魏国建国之初，钟繇任大理，升迁为相国。文帝在东宫做太子时，赏赐给钟繇“五熟釜”，在釜上铭刻文字说：“堂堂魏国作汉室屏障。可作相国的人惟有钟繇，实在像心脏脊骨一样重要，整夜毕恭毕敬，不知怎样安处，您是百官的师长，记在这里以为众人的楷模。”几年后，钟繇因西曹掾魏讽谋反事株连，被罢免官职。
文帝即王位后，钟繇又任大理。到了文帝即帝位，改任廷尉，晋升爵位被封为崇高乡侯。又升迁为太尉，转封为平阳乡侯。当时司徒华歆、
